| 施設No. | 施設名 | 取得年 | 更新年 |
|---|---|---|---|
| 1281 | 熊本大学医学部附属病院 | 1981 | 2026 |
| 1282 | 済生会熊本病院 | 1982 | 2026 |
| 8105 | 熊本地域医療センター | 1988 | 2027 |
| 16032 | 天草地域医療センター | 1996 | 2026 |
| 17045 | 服部胃腸科 | 1997 | 2027 |
| 23049 | 熊本赤十字病院 | 2003 | 2027 |
| 24066 | 熊本市立熊本市民病院 | 2004 | 2025 |
| 20050104 | 国家公務員共済組合連合会 熊本中央病院 | 2005 | 2026 |
| 20080076 | JCHO熊本総合病院 | 2008 | 2026 |
| 20090072 | 医療法人創起会 くまもと森都総合病院 | 2009 | 2027 |
| 20110073 | 公益財団法人 熊本県総合保健センター | 2011 | 2026 |
| 20170033 | 西日本病院 | 2017 | 2026 |
| 20220090 | くまもと県北病院 | 2022 | 2025 |
| 20240058 | JCHO人吉医療センター | 2024 | 2027 |
| 20240059 | 熊本労災病院 | 2024 | 2027 |
| 20240060 | 大腸肛門病センター高野病院 | 2024 | 2027 |
| 20180061 | （連携）国保水俣市立総合医療センター | 2018 | 2027 |
| 20190083 | （連携）社会医療法人潤心会 熊本セントラル病院 | 2019 | 2025 |
| 20210092 | （連携）国立病院機構 熊本医療センター | 2021 | 2027 |
| 20220091 | （連携）医療法人起生会 表参道吉田病院 | 2022 | 2025 |
| 20220092 | （連携）山鹿市民医療センター | 2022 | 2025 |
| 20220093 | （連携）医療法人春水会 山鹿中央病院 | 2022 | 2025 |
| 20230059 | （連携）荒尾市立有明医療センター | 2023 | 2026 |
